Project Portugal 2020

Operation code Code that identifies each project carried out using European funding.

Conclusion date

Summary

1 Otimização do diagnóstico laboratorial para rastreamento. Objetivo: tornar o processo mais célere, menos dispendioso, garantindo a sua sensibilidade. A testagem por PCR que está atualmente implementada baseia-se na colheita nasofaríngea/orofaríngea, e não é suficientemente célere ou económica para a necessidade prevalecente de manter o rastreio regular da população. De modo a melhorá-lo desenvolveremos várias atividades, nomeadamente: # otimização do uso de saliva como amostra biológica para rastreio COVID-19 no que se refere aos reagentes necessários, e à definição de parâmetros otimizados para o seu processamento e análise; # implementação e otimização da metodologia de PCR Multiplex de modo a permitir a realização simultânea das 3 reações, triplicando a capacidade de testagem, e potenciando a identificação, avaliação e reporte célere de casos positivos; # Otimização de RT-PCR direto partindo do procedimento in-house de PCR e procedendo à remoção do passo de análise do RNA viral # Otimização de diagnóstico molecular em pooling de amostras. Otimização de vários parâmetros amostrais (p. ex. o volume da reação/amostra, nº de amostras) de forma a permitir o aumento da capacidade de análise simultânea sem comprometer a reprodutibilidade, sensibilidade e/ou o limite de deteção. #Otimização da automatização do sistema de amostragem, agendamento de testes e comunicação de resultados. Visando melhorar a capacidade de funcionamento, num tempo mais reduzido e com menor intervenção humana. 2 Estudos associados à prevalência de SARS-CoV2. O aumento da capacidade e da fiabilidade de testagem, que desenvolveremos, permitir-nos-á adicionalmente contribuir para o aumento do conhecimento científico. Assim faremos: # A caracterização de parte da população da região, por desenvolvimento de uma análise epidemiológica, a partir dos dados recolhidos. # O estudo de prevalência dos níveis de anticorpos para o SARS-CoV2 em indivíduos, vacinados vs. recuperados, uma vez que a duração da imunidade ao SARS-CoV-2 ditará o curso geral da dinâmica pandémica e pós-pandémica. O estudo cinético destes anticorpos (o “timing” da sua seroconversão bem como o cálculo da estimativa da sua permanência em circulação) será possível a partir dos dados que serão recolhidos trimestralmente, e durante um ano, através de testes rápidos de anticorpos e de imunodeteção enzimática (ELISA) em amostras de soro. # O estudo de interações Animal-Homem monitorizando a presença de Coronavírus, incluindo SARS-CoV2, em aquaculturas de bivalves no Sado contribuindo para o conhecimento e eventual prevenção de potenciais pandemias associadas a zoonoses. Para tal serão colhidas e analisadas, seguindo protocolos específicos disponíveis na literatura, amostras de águas em zonas de emissários de águas residuais e de aquaculturas de bivalves na região de Setúbal. As amostras positivas serão sequenciadas para identificação de eventuais VOC e tipos de coronavirus.